منذ الإنطلاقة المباركة وبغية دمج البحث العلمي بالجانب التعليمي كان للجامعة اهتماماً خاصاً بالإنتاج الفكري والعطاء العلمي، فأقيمت محاضرات ودورات في كيفية إعداد الرسائل وفنون وأصول البحث العلمي، كما اعتمدت البحوث الفصلية منذ العام الثاني في مرحلة البكالوريوس.

واعتمدت قوانين وضوابط دقيقة لاعتماد بحث التخرج في مرحلة البكالوريوس ورسالة التخرج لمرحلة الماجستير وأطروحة الدكتوراه، وكل هذه النوايا الصادقة والجهود الحثيثة ساهمت في إنجاز عشرات البحوث الفصلية، وما يزيد عن 120 بحث ورسالة، كما تمكن طلاب الجامعة من نيل الامتيازات العليا في المسابقات العلمية التي تقام على مستوى الحوزات العلمية بمدينة قم المقدسة وهكذا تكون الثمار قد آتت أكلها وازداد النضج الفكري في واحات هذه الجامعة.
كما تعنى هذه العمادة بالمناهج الدراسية والنخب الطلابية وببرامج المتخرجين في مجال التدريس والتبليغ والتحقيق والأعمال الثقافية والتربوية والترجمة وشتى الأنشطة للمتخرجين.